Pour une fois, le NCIS n'enquête pas sur un meurtre mais une disparition, celle du sergent chef Bill Atlas. La veille au soir, dans un bar, Atlas confiait ses craintes à sa maîtresse, Carol Powers, une journaliste. Deux de ses anciens frères d'armes ont disparu et il redoutait de subir le même sort. Après avoir interrogé la serveuse du bar et la journaliste, Gibbs cible Joe Sacco, le supérieur d'Atlas. Trois membres de la mission qu'il dirigeait aux Philippines, dont Bill Atlas, ont disparu sans laisser de trace. Tandis que l'enquête suit son cours, le sergent, enchaîné par un invisible tortionnaire, croupit dans les égouts de la ville...
